El lago se halla entre el Lago San Martín y el Lago Viedma, con este último se comunica mediante el río de Las Vueltas.
El Lago del Desierto ofrece un paisaje agreste rodeado de bosques con frondosos árboles que alcanzan los 15 metros de altura. Detrás del lago se halla el famoso Campo de Hielo Patagónico Sur. El mismo posee la masa de hielo continental más importante de nuestro planeta luego de la Antártida.
En el lugar también podemos encontrar gran cantidad de flores silvestres y entre los animales que habitan en el lugar se destacan Los Zorros grises, Hurones, Guanacos, Gatos Montes y gran variedad de Aves.
El lugar es ideal para los turista fanáticos de la pesca ya que es un lago pequeño donde se pueden obtener truchas arco iris de un promedio de un kilo, aunque también se pueden llegar a conseguir ejemplares de 3; 4 o 5 kilos.
Sus aguas cristalinas y el paisaje es boscoso andino patagónico virgen poseen muy poca presión de pesca por lo que se vuelve mucho más fácil la labor de los pescadores.
En las cercanías del Lago del Desierto existen lagunas escondidas que tienen muy buena pesca a las cuales se llega haciendo trekking y conociendo la zona.
Otra actividad que se destaca es el trekking con excursiones que parten desde El Chaltén recorriendo los 40 kilómetros de camino de ripio que separan dicha ciudad del Lago.